宝能系曾经是万科的第一大股东。2015年12月6日，万科发布公告称，钜盛华通过资管计划在深交所证券交易系统集中竞价交易买入万科A股股票5.49亿股，占总股本的4.969%。此次权益变动后，钜盛华及其一致行动人前海人寿合计持有万科A股股票22.11亿股，占公司总股本的20.008%，取代华润成为公司第一大股东。
而到了去年6月，深圳地铁集团在接过中国恒大原本持有15亿股万科股份后，持股比例达到29.38%，超过宝能系成为第一大股东。
截至今年一季度，万科的第一大股东仍然是深铁集团，持有股比为29.38%。在前十大股东中，宝能系的钜盛华持股8.39%、国信证券持股4.14%、前海人寿持股3.17%和1.98%、安邦持股2.34%和2.21%、西部利得基金2.04%，合计24.27%。香港中央结算公司持有股份11.91%。
如今，宝能系仍然持有万科A股22%的股份，按照股权结构来看，宝能仍为万科第二大股东。
不过，此前有分析人士称，这样体量的大宗交易一般会提前找好接盘方，但根据各方信息来看，目前尚不确定谁是宝能的“接盘者”。也有消息称，宝能可能是在“左手换右手”，降低杠杆后自己接盘。
