这个问题是《红楼梦》中一个非常精妙且充满哲思的“矛盾”，也是理解曹雪芹艺术手法和核心思想的关键之一。这个问题的答案，可以从以下几个层面来理解：一、字面与实体的矛盾——两个不同的“玉”
首先，最关键的一点是：“神瑛侍者”和“通灵宝玉”是两个不同的实体。
1、神瑛侍者：这是贾宝玉的前世，是天上的神仙，住在“赤瑕宫”。他因凡心偶炽，意欲下凡造历幻缘，于是投胎成了贾宝玉。“神瑛”意为“晶莹的美石”，“侍者”表明其身份。
2、通灵宝玉：这本来是女娲炼石补天时剩下的一块顽石，因无材补天，日夜悲号。后来被僧道点化，变成了一块“通灵宝玉”。它被神瑛侍者夹带下凡，成为了贾宝玉出生时口中所衔的美玉，也是贯穿全书、我们时常见到的那个“通灵宝玉”。
所以，简单来说：贾宝玉的“肉身/灵魂”是神瑛侍者，而他脖子上挂的“玉”是那块顽石/美玉。 一个是人，一个是物。
二、“赤瑕宫”与“美玉无瑕”的寓意
现在我们来看“瑕”字的矛盾。
1、赤瑕宫
“赤”指红色，暗合全书“红”的基调（红楼、怡红公子等），也象征着人间富贵与情感。“瑕”字的本义是“玉的斑点”。“赤瑕”可以理解为“带有红色斑点的玉”。这恰恰是在暗示神瑛侍者（即贾宝玉）本身就是有“瑕疵”的。他的瑕疵是什么？就是他动了“凡心”，有了情欲，这正是他下凡历劫的根源。这个“瑕”预示了他将堕入充满不完美和苦难的红尘世界。
2、美玉无瑕
这个词出自《红楼梦》十二支曲中的《枉凝眉》，是用来形容贾宝玉和林黛玉的：“一个是阆苑仙葩，一个是美玉无瑕。”这里的“美玉无瑕”指的是贾宝玉这个人。在黛玉的眼中，在她的前世“绛珠仙草”的视角里，恩人神瑛侍者是完美无缺的。这句诗是情感的、理想的表达，描绘的是黛玉心中纯净、理想的宝玉形象，而不是对他脖子上那块石头的写实描述。
三、矛盾的统一与深刻的寓意
曹雪芹故意设置这个“矛盾”，其深意在于：
1、对“完美”的消解与反讽
书名《红楼梦》又叫《石头记》，主角就是那块“无材补天”的顽石。它本就是被淘汰的、有缺陷的。即使它被幻化成“美玉”，其本质依然是“顽石”。书中反复强调“假作真时真亦假”，这块玉被世人（如贾府众人）视为祥瑞、命根子，但它其实是“假宝玉”。所谓“美玉无瑕”在现实中是不存在的，这只是一种理想化的幻象。而真正“无瑕”的，是宝玉那颗赤子之心，但这颗心在世俗看来，反而是“潦倒不通世务”的“痴病”。
2、“瑕”才是人性的真实
神瑛侍者住在“赤瑕宫”，点明了他的本质——一个有欲望、有缺点、向往人间的“人”。而“通灵宝玉”作为观察者和记录者，它看到的正是这个人世间（贾府）的种种“瑕疵”——贪婪、虚伪、衰败。作者想表达的正是：人生和人性本就是有“瑕”的，绝对的“无瑕”只存在于理想和诗词之中。 宝玉的悲剧就在于，他带着“瑕”的本质，却追求着“无瑕”的情感与境界（如对黛玉的纯真之情），最终在现实的碾压下归于幻灭。
3、文学上的呼应
“赤瑕”与“无瑕”形成了一组鲜明的对照。一个是出身的宿命与本质，一个是他人眼中的理想与幻象。这个矛盾恰恰构成了贾宝玉人物性格的张力，也是全书“理想与现实”冲突的缩影。
总的来说：
“赤瑕宫” 指的是贾宝玉（神瑛侍者）的前世居所，暗示其本身带有“情欲”的瑕疵，注定要入红尘。
“美玉无瑕” 是林黛玉眼中理想化的贾宝玉形象，是一种情感投射和文学上的赞美。
而贾宝玉脖子上挂的 “通灵宝玉” ，其本质是 “顽石” ，在世俗眼中是“美玉”，在哲思层面则象征着“虚妄”与“假象”。
所以，这并不是作者的笔误，而是曹雪芹精心设计的、充满机锋的隐喻。他通过这种看似矛盾的手法，深刻地揭示了《红楼梦》的主题：一切繁华与美好，终究是“赤瑕”般的梦幻泡影，而人们所追求和歌颂的“无瑕”，在尘世中是无法长存的。
